疫苗免疫只是動物疫病防控的措施之一，不一定打了防疫針就不會發生疫病，同時還要做好飼養管理、消毒、規範引種等工作。打了疫苗發病，主要有以下幾種情況：
1、母源抗體的干擾。多數病毒性和部分細菌性烈性傳染性豬病母豬免疫後，仔豬在母源抗體水平較高時進行同種疫苗的免疫，會受到母源抗體的干擾。如豬瘟免疫規範的母豬，出生仔豬獲得的豬瘟母源抗體持續28天后開始快速下降，豬藍耳病母源抗體持續21天，仔豬出生一週內免疫以上疫苗會受到母源抗體的嚴重干擾，無法產生預期的免疫效果。
2、免疫操作不規範。疫苗免疫過程中，注射部位不準確、不消毒，注射深度不夠，針頭不按豬齡選擇長度，不更換針頭一針到底，甚至還打飛針，皮下、皮內、肌肉注射分不清等問題比較普遍，導致免疫後抗體水平不整齊或不合格，疫苗免疫後不能起到較好的保護效果。
3、疫苗質量因素。疫苗質量直接影響免疫成敗。豬常用疫苗種類多達10多種。疫苗的儲存、運輸、稀釋、使用等環節，也能造成疫苗變質、效價下降，導致免疫失敗。
4、免疫抑制的影響。免疫抑制是在外界因素作用下，免疫組織器官受到損傷，免疫細胞呈遞抗原能力受到阻斷和抑制，機體免疫應答不全，在低致病力和弱毒病原的感染下都能引發疫病。造成機體免疫抑制的因素很多，如黴菌毒素、重金屬、放射性輻射、應激因素、營養不全、維生素缺乏以及藍耳病和豬圓環病毒病等。目前免疫抑制在豬群中普遍隱性存在，不同豬群免疫抑制程度不同而已，豬場應高度重視免疫抑制現象，做好相應的預防和控制。
5、飼養管理因素。營養不全價、設施裝置不健全、豬群生活環境較差，生長所需的營養得不到滿足，機體健康水平得不到保障。因此，免疫接種後豬群抗體水平不能達到預期水平和保護力，導致豬群免疫失敗，易引發突發性重大動物疫情。
6、注射疫苗前，該種病處於潛伏期，免疫後發病。
要預防免疫失敗，應做好以下幾個方面的工作：
1、科學飼養管理，提升健康水平。養豬場要圍繞自繁自養、全價料飼養、程式化免疫、制度化消毒、科學化用藥、保健性防疫等科學的飼養管理來提升豬群健康水平。
2、免疫與監測相結合，避免盲目免疫。傳統的養豬場戶認為注射了疫苗就萬事大吉，而且對免疫接種和取樣監測有排斥性。免疫和監測是相輔相成的，透過監測可以確定仔豬首免時間，根據監測結果評價免疫效果，制定補免時間，利用監測來預測一些疫病的潛在威脅。對豬群不同時期的跟蹤監測是科學合理地制定免疫程式的依據，可以避免免疫的盲目性，確保免疫的時效性。科學的監測能避免母源抗體的干擾，發現病原微生物的隱性感染，避開疫苗間的相互干擾，提升免疫質量。
3、避免免疫抑制，消除潛在隱患。豬群免疫抑制現象普遍存在，而且逐步成為影響豬群健康的重要因素。免疫抑制是機體破壞免疫系統抵抗的一種無形殺手，但也是可以避免和控制的。使用正規廠家生產的飼料，控制飼料黴變因素；監測水源、飼料的重金屬含量、放射性射線的汙染等物理因素；淘汰病原性免疫抑制豬隻和豬群，控制病原性免疫抑制因素；根據不同年齡飼餵不同營養價值的全價飼料，提高免疫力；加強疫病監測、減少轉群等應激，消除疫病和應激造成的免疫抑制現象。
4、疫苗保質保量，確保免疫效果。疫苗質量低劣和不規範操作是免疫失敗的重要原因。選擇正規企業生產或政府採購疫苗，使用匹配的稀釋液和規定稀釋度進行疫苗稀釋，稀釋後要在規定的時間內用完，否則不能再使用。疫苗注射時按照說明書所述的免疫劑量、注射部位、注射方式進行免疫，免疫前後停用抗生素5天左右，確保細菌性疫苗免疫後不被清除；接種時按豬隻大小選擇不同規格的針頭，並避免漏免，保證疫苗免疫的質量和效果，減少免疫失敗的發生。
