新疆棗樹病蟲害種類有200多種，南疆棗樹發生較重的病蟲害有棗癭蚊、棉鈴蟲、葉蟎、棗大球蚧、皮暗斑螟、棗黏蟲、棗黑斑病、棗縮果病、棗裂果病等。現將棗樹主要病蟲害的發生與防治技術簡介如下。
一、棗癭蚊
棗癭蚊主要發生在4月下旬，該蟲主要為害幼葉、嫩葉，因此花前期防治尤為重要。防治棗癭蚊應採取地上、地下全防原則，還可懸掛誘蟲燈誘殺成蟲。藥劑一般可選用80%敵敵畏乳油1000倍液、2.5%敵殺死乳油2500倍液、90%敵百蟲晶體600～800倍液、48%樂斯本乳油1500倍液，在使用上述藥劑的同時可加入酒精1000倍液，可提高殺蟲質量。
二、棉鈴蟲
棉鈴蟲主要發生在7月中下旬即幼果期後，該蟲主要為害果實，因此幼果期防治尤為重要。棉鈴蟲成蟲趨光性強，可在園內懸掛誘蟲燈誘殺。於幼蟲發生期噴灑氯氟氰菊酯乳油1000倍液等藥劑。
三、葉蟎類
葉蟎類主要有硃砂葉蟎、二斑葉蟎、山楂葉蟎等害蟎，主要為害葉片背部，早防早治尤為重要。萌芽前用5波美度石硫合劑全園噴施，生長期一般可選用1.8%阿維菌素乳油4000倍液+24%螺蟎酯懸浮劑4000倍液、1.8%阿維菌素乳油4000倍+20%四蟎嗪懸浮劑5000倍液，在使用上述藥劑的同時可加入酒精1000倍液，可提高殺蟲效果。噴藥時務必細緻周到，葉片正面、背面均要噴藥。
四、棗大球蚧
萌芽前用5波美度石硫合劑全園噴施，可有效防治棗大球蚧的發生。棗大球蚧若蟲期可選用48%樂斯本乳油1500倍液防治。還可人工剪除蟲枝或人工摘除介殼等。
五、皮暗斑螟
皮暗斑螟主要發生在棗樹主幹嫁介面或環割口處，造成傷口不能完全癒合或全部斷離，導致樹勢衰弱，樹體越冬死亡。一般可選用90%敵百蟲晶體200倍液或48%樂斯本乳油400倍液等藥劑塗抹環割口，5～7天塗抹1次，連續3次即可。還可使用糖醋液(白酒、紅糖、醋、水按1∶1∶4∶20混合，加少量敵百蟲)誘殺，防效較好。
六、棗黑斑病
棗黑斑病夏季花期發病輕，秋季大暴發。以菌絲在棗樹芽鱗和皮痕內越冬，可透過傷口和自然孔口侵入，主要為害葉片和果實，7月下旬和8月上旬為發病盛期。該病在果實迅速膨大期(7月初)開始發病，先在果實表面出現潰瘍狀斑點，呈圓形或近圓形，多數病果上有數個斑點，多者達十幾個。病斑中央有一小孔，向外分泌白色黏狀物。隨著果實的生長，病斑不再繼續擴大，病部變褐、變黑，變成一個黑疔。在果實採收時，部分小黑疔脫落，留一傷疤，影響果實外觀。大部分病果黑斑不脫落，降低或失去商品價值。
防治方法如下:①保護性殺菌劑 發病前噴保護性殺菌劑，主要推薦80%大生M-45(代森錳鋅)可溼性粉劑800倍液，於蕾期、初花期防治。②治療性殺菌劑
發病後噴治療性殺菌劑，幼果膨大期及白熟期主要推薦80%福美雙(倍彤樂)水分散粒劑600～800倍液、25%咪鮮胺乳油5000倍液、40%信生可溼性粉劑800倍液、62.25%仙生可溼性粉劑500～600倍液、70%丙森鋅(安泰生)可溼性粉劑500～700倍液等藥劑。
七、棗縮果病
加強果樹後期管理，增施磷、鉀肥。藥劑可選擇80%大生M-45可溼性粉劑800倍液、62.25%仙生可溼性粉劑500～600倍液、72%農用鏈黴素可溶性粉劑3500～6000倍液等。
八、棗裂果病
棗裂果病由果實含鈣量不足造成。從幼果期開始補鈣，至果實白熟期全期補鈣4～5次。可使用各種劑型鈣製品。
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