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科學家和醫生正籌備基因醫學並為納入醫保清除障礙


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更新日期:2022608
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日前《人類突變》專刊重點報道了NIH的ClinGen和ClinVar項目取得的進展。這些項目致力於研究基因突變和疾病與健康之間的關聯,為基因醫學納入醫保掃清了最後的障礙。

由於基因突變和疾病與健康之間的關聯缺乏確切證據,一直是基因醫學納入醫保的主要障礙之一。

由美國國立衛生研究院資助的ClinGen和ClinVar項目的目標就是確定哪些基因和基因變異在人類疾病中承擔作用,成為了未來基因醫學的基石。

《人類突變》專刊重點報道了該項目所取得的進展,項目彼此的協作,將基因組變異與人類健康聯系起來,成為了治療疾病從基因入手的最直接依據。

整合多方資源的ClinGen項目

2013年,美國國家人類基因組研究所(NHGRI)在尤尼斯•肯尼迪•施萊佛國家兒童健康與人類發展研究所和美國國家癌症研究中心(NCI)的共同支持下,對ClinGen立項。

ClinGen的目標是整合臨床與基礎研究專家的技術力量和資源,為分析基因變異數據與健康和疾病之間的關系開發標准化流程。這些專家確定每種變異對疾病的診斷和精准治療意味著什麼。

基因變異的信息存儲在ClinVar數據庫,由NIH國家生物技術信息中心(國家醫學圖書館的一部分)資助和維護更新。

NHGRI主任埃裏克·格林博士指出:為了實現ClinGen和ClinVar項目的目標,來自230個機構超730名研究人員,臨床醫師和IT管理者密切合作,致力於與人類疾病有關的基因和基因組變異的標准化評估體系建設。最終,這些成果將促進基因醫學的應用,為所有患者提供更高質量的醫療護理和精准治療。

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提供的證據

ClinGen項目的研究人員開發出一個“基因——疾病”有效性框架來評估基因變異在特定疾病中的作用。由來自世界各地在癌症、神經發育障礙和心血管疾病等領域頗有建樹的臨床醫生和研究人員,組成的14個基因數據管理專家小組正在對這種評估方法進行驗證測試。

其中,兩個專家小組報告了與癲癇和RASopathies相關的基因;後者是一組罕見的遺傳疾病,包括Noonan綜合征、Cardio-Facio-Cutaneous綜合征、Costello洛綜合征和Legius綜合征。

16個與癲癇相關基因中有8個基因沒有足夠證據支持它們在疾病中所起的作用;另外20個與RASopathies相關基因中有6個基因也沒有足夠證據支持其在疾病中的作用。

這些發現有助於指導實驗室決定將哪些基因作為診斷評估或進行測試。

ClinGen項目的研究人員還采納了美國醫學遺傳學與基因組學學會(ACMG)和分子病理學協會制訂的指導方針,識別致病性基因變異和非致病的變異。

在發表的四篇論文中,ClinGen的變異臨床專家小組對如何制定指導方針來處理這些基因變異進行了概述,包括聽力損失、CDH1(與胃癌和乳腺癌相關)、PAH(與苯丙酮尿症相關)和PTEN(與腫瘤綜合征相關)。

未來,臨床醫生可以使用ClinVar數據庫中收錄的基因變異來判斷患者的基因變異是否是致病性基因變異。研究人員也可以選擇某些基因變異進行基礎實驗室的研究,包括精准藥物和基因編輯技術的開發。

ClinGen的研究人員還開發了一種方法來評估臨床上的次要基因變異。這種情況是指在一個人身上發現的疑似致病基因變異,它們不是作為疾病診斷依據的重點,但是重要的參考指標。

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數據共享

ClinVar數據庫收集了有關基因變異及其與人類健康相關的信息,提高了共享和對比來自不同研究項目和臨床疾病組別基因變異分類的能力。

ClinGen項目的患者注冊表“GenomeConnect”已將接受過基因檢測患者的基因變異和臨床數據提供給ClinVar。截至2018年4月,已有來自32個國家的1601名參與者注冊了GenomeConnect。

注冊表還可以使患者與臨床醫生、研究人員和其他參與者建立虛擬聯系。當進行測試的實驗室更新其基因變異的信息時,注冊中心的參與者也可以收到提醒信息。到目前為止,已鑒定了13項更新,並反饋給接收此信息的參與者。

一種通用的“基因語言”

為了開發一種通用的“基因語言”,使基因組數據庫能夠相互“交流”,ClinGen開發人員建立了ClinGen等位基因注冊中心,實現了基因變異的通用識別。注冊中心的數據模型符合全球基因組學與健康聯盟的基因組知識標准工作流程。

NHGRI的ClinGen項目負責人拉莫斯博士認為:這是對已知人類基因數據應用一個巨大的挑戰,人們正在努力開發自動化方法並加速工作流程,甚至人工智能化應用。在不遠的將來,應用臨床常規基因檢測越來越普遍,目的是了解哪些基因變異導致了個體疾病,對選擇最恰當、最精准的治療將是事半功倍。

如此看來,現在的臨床診斷和藥物治療是何等粗糙和原始。真正的精准醫療——基因醫學才是人類所期盼的夢想和健康保障。

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